ciao,
innanzitutto è meglio non postare codice malevolo.
In secondo luogo occorre mettere il sito off-line
poi procedi ad una "bonifica" del codice sospetto e secondo me:
sovrascrivendo i file di joomla 2.5.14 con uguale identica versione
sovrascrivendo i file del template che usi con quelli originali (se hai fatto delle modifiche le perd)
re-installando eventuali componenti aggiornate: jce/framework e sostiruendo il file .htaccess (se è presente-) con uno originale funzionante,
credo che al 99% dovresti avere risolto.