in realtà non c'è motivo per cui VM cambi ciò che è al di fuori dell'area component del template.
non dovrebbe farlo e, in teoria, non potrebbe, almeno senza un plugin di tipo system.
ciò che virtuemart e/o tu potete fare è cambiare il template, ed infatti se vedi la pagina con il logo usa td-okini, mentre quella senza td-okini_rosso.
pertanto se non in VM->configurazione -> modelli, guarda nelle impostazioni del template quali templates sono associati alle singole voci di menù.
ciao,
marco