Per quel ne so, penso non sia possibile ad ora. Dovresti dare un'occhiata alla funzionalità "Venditori", che tuttavia ha ancora (anche nella 1.1 beta) una scritta drammatica:
This feature is still in an early ALPHA stadium. Don't use it if you're not sure how to debug it. virtuemart is not really capable of managing multiple vendors
A parte il fatto che se vuoi mettere i negozi su due domini diversi, non puoi condividere il database, a meno di usare un server tuo...
In mancanza di questo, una possibilità interessante potrebbe essere separare fisicamente i due siti, sincronizzando poi regolarmente prodotti e prezzi; per fare questo potresti usare le funzionalità di importazione/esportazione CSV integrate in VirtueMart.