Risolto, avevo una copia del sito e ho ricaricato tutto, trasferendo il "vecchio" in una sottocartella (non si sa mai), ha tenuto tutti i parametri e i moduli creati (non avendo cambiato database) l'unica cosa che ho dovuto copiare dal "vecchio" sito è la cartella images, in quanto tutti i collegamenti e i moduli (tipo le gallery) rimangono ma non avendo foto non si attivano, sostituita anche quest'ultima cartella funziona tutto perfettamente!
Per curiosità ho provato anche a sostituire cartella per cartella lo zip scompattato di joomla, cercando di non sovrascrivere la cartella moduli componenti e plugin del mio vecchio sito e anche questa soluzione funziona.
Ovviamente sostituendo tutte le cartelle si andava a "resettare" tutto il sito e le impostazioni.