ciao lellone, cortesemente evita riferimenti a servizi commerciali sul forum. Poichè è un problema relativo al tuo server devi rivolgerti al tuo provider direttamente. In generale posso dirti che qualunque file può essere spezzettato e ricomposto successivamente e che non esiste solo il metodo di caricamenti via ftp (solitamente infatti è disponibile nel pannello di controllo dell'hosting un file manager per la gestione ed il caricamento dei file). Sicuramente, se non haigià cancellato tutto, nella cartella del componente akeeba c'è un backup del sito ancora disponibile (o forse più di uno!): puoi utilizzare subito quello anzichè caricare il tuo.
Prima di passare al ripristino comunque è bene ricontrollare i permessi di file e cartelle che se ripristinati talvolta possono rimettere a posto tutto. In più ricorda che tutto ciò che fai nel pannello di controllo di joomla-> configurazione globale, può essere impostato anche modificando il file configuration.php
