la differenza non la fa il modulo in se stesso, ma dove e come viene inserito il codice.
quindi per lo slider in alto, presumo che questo codice venga letto prima di qualcosa e per quello in basso dopo quel qualcosa.
riattiva jquery nel modulo e vai in
/templates/tk_gen_free_ii/warp/libraries/jquery/jquery.js
via ftp:
rinomina jquery.js in _jquery.js e riprova.
se ancora non funziona non ho altre opzioni da darti, in genere risolvo sempre tutti i conflitti ma solo quando tocco con mano direttamente il sito, stare ad indicarti fai questo, fai quello, pigia li , strombetta li e ci mettiamo pure che non sempre ci capiamo, fa diventare la cosa più difficile del normale.