Ciao, utilizzo il JCE da molto tempo e non mi è mai successo.
Sei certo che hai installato la versione aggiornata ?
Ti consiglio di tornare sui tuoi passi, di disinstallare l'editor e installarlo di nuovo,
di considerare poi nel caso che il problema continui, un incompatibilità con il template in uso.

E andare a modificare quello.