basta creare una cartella all'interno della cartella principale in remoto, la nuova cartella la chiami come vuoi tu all'interno copi i file di joomla come se fosse una nuova installazione.
Ovviamente devi avere giao un secondo DB, accedi alla cartella nei piu classici dei modi es: nome_sito/nuova_cartella ti parte l'installazione di joomla,
fai la procedura guidata di installazione e il gioco è fatto.
per accedere all'area amministrativa della nuova installazione sara : nome_sito/nuova_cartella/administrator
Saluti.