è più corretto parlare di ombreggiare i moduli dentro la colonna, ma il codice così come è offre già una lieve ombra, basta accennarla un pò di più
.well {
background-color: #f5f5f5;
border: 1px solid #e3e3e3;
border-radius: 4px;
box-shadow: 0 1px 1px rgba(0, 0, 0, 0.05) inset;
margin-bottom: 20px;
min-height: 20px;
padding: 19px;
}
la riga dove intervenire per l'ombra è questa
box-shadow: 0 1px 1px rgba(0, 0, 0, 0.05) inset;