Ho chiamato il provider e mi dice come sospettavo che in pratica PayPal mi sta chiedendo di implementare il sito con SSL. Quindi tornando a Joomla, una volta acquistato il pacchetto SSL l'unico settaggio richiesto nel back-end di Joomla sarebbe Forzare SSL su tutto il sito? O dipende dal componente in uso? (PayPal viene usato dal componente).
EDIT:
Aggiunta a beneficio di chi dovesse ricevere quella email da PayPal (ok ho capito che c'entra poco o nulla con Joomla ma visto che la thread ormai è fatta), ho chiamato PayPal e mi dicono di ignorare l'email perchè probabilmente il mio sito Joomla non ha attivato l'IPN, riescono a saperlo perché quando ricevo un pagamento mi arriva unicamente l'email di PayPal dell'avvenuto pagamento, se avessi avuto IPN attivo avrei ricevuto due email ad ogni pagamento, una dal mio sito ed una da PayPal.