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Mi capita solo con questi due componenti che sono stati installati successivamente.
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Probabilmente il tuo problema non è con i
CHMOD ma con il
chown un altro tipo di permesso.
Probabilmente l'hosting dove sei ha una versione 1 di Apache, probabilmente tutte le operazioni eseguite via web creano un assegnazione "nobody" ai file/cartelle create non via FTP.
Unica soluzione è chiedere all'host di ripristinare i permessi
chown.