Mah, difficile.
Se hai fatto il ripristino dopo aver cancellato tutto il preesistente, tabelle di database compreso, allora è qualcosa che riguarda proprio il server, ma vai a capire di che si tratta !
Altrimenti potrebbero essere presenti dei file extra joomla dentro il sito.
Fammi sapere, quando ne verrai a capo.
Ciao!