se non sbaglio htaccess è una prerogativa di linux e NON di winzozz.
in ogni caso su sh400sef c'è l'apposita opzione che ti permette di usare htaccess oppure farne a meno, forse se installi questo funziona tutto e poi prova a vedere se hai settato l'opzione giusta, e cioè niente htaccess...
ciao
jk
p.s. non sono per niente esperto, ma siccome sono ore che mi sto smazzando esclusivamente sh404 le opzioni ormai me le ricordo a memoria...