Cioè ha fatto partire l'installazione di un nuovo pacchetto joomla?
..o hai solo copiato i files?
ha utilizzato l'opzione presente nel componente di aggiornamento, quando si ha l'ultima versione installata e si clicca su cerca aggiornamento compare il pulsante reinstalla i file del core di joomla!
Per l'esperienza che ho io penso che le uniche alternative rimaste siano: provare a fare un backup con
akeeba e ripristinarlo per vedere se si corregge il problema, ma ne dubito, seconda opzione, piu sicura, esportarsi le tabelle del content, meglio ancora solo quelle relative hai contenuti inseriti dopo l'aggiornamento fatto tramite FTP, ed eventualmente quelle degli utenti se ci sono state registrazioni nuove, ripristinare il backup precedente l'aggiornamento ftp aggiornare tutto e reimportare le tabelle, in alternativa installare
j2xml esportare i nuovi articoli/categorie/utenti, ripristinare il backup, aggiornare tutto, installare j2xml ed importare i contenuti esportati precedentemente, questa opzione è piu semplice perche export/import si effettuano tramite estensione