Sembra che il problema maggiore sia per quei template pieni di ammennicoli per i vari settaggi, Joomla 4 porta con se nuove classi, quindi ve ne saranno alcune deprecate influenzando tutte quelle estensioni che le utilizzano.
per chi invece utilizza template auto-costruiti o basati solo sulle direttive ufficiali MVC, quindi NO template basati su Framework, non dovrebbe avere nessun problema.
Chi invece utilizza template basati su T3, Gantry, Yotheme, Elix ed altri che non sto a scrivere, avrà qualche piccolo malfunzionamento che dovrebbe essere messo a posto aggiornando gli stessi, sia come template e sia come framework.
per il discorso versione bootstrap potete stare tranquilli fin quando la versione presente in CDN è presente, mentre se è incorportata il problema non sussiste.
