...Sbirciando il codice del tuo sito manca la classe nav-pills dove essa dovrebbe essere...
E se la aggiungo con gli strumenti per sviluppatori di Firefox il menu diventa orizzontale, come deve.
Se il tuo menu non prende la classe nav-pills, o ci sono problemi a monte che non saprei, o non l'hai inserita correttamente nel posto giusto...