JCE è una estensione "normale", si aggiorna usando il canonico "Aggiorna estensioni".
Se non vedi l'aggiornamento (caso strano, che può essere indice di qualche problema di installazione), riscarica il pacchetto dal sito e reinstallalo. La versione base è gratis, e non c'è problema a installare la versione nuova su quella vecchia.
Se avevi la versione PRO a pagamento, e la tua licenza è scaduta, l'aggiornamento non andrà a buon fine (ma almeno dovrebbe segnalartelo).
