Adesso mi metti in crisi!

Non conosco MJ frontpage ma faccio un ragionamento per logica: se ti ha fatto disattivare l'uso delle pagine di amministrazione (intendo quelle che usi accedendo all'indirizzo
www.miosito.it/administrator) allora vuol dire che non la usi e che MJ frontpage gestisce l'amministrazione del sito per conto suo.
In ogni caso c'è sempre la possibilità di tornare indietro se qualcosa non dovesse funzionare.
Se proprio hai il terrore di sfasciare tutto (e lo capisco visto il sito!)

potresti aprirti uno spazio web temporaneo su netsons.org, caricare il sito (se non supera i 100Mb) e il DB e poi fare l'upgrade.
Se tutto va bene puoi fare l'upgrade sul sito principale.
Fra l'altro nel wiki sono state aggiunte due interessanti miniguide per il backup automatico giornaliero sia del DB che dell'intero sito.