Si, per quello che riguarda il database è sicuramente una questione di permessi.
La dimostrazione, giustamente, l'hai avuta da solo visto che amministri un altro database sullo stesso server.
Per modificarli devi chiedere al tuo hoster perchè solo lui può modificarli.
Sul database dovresti avere tutti i permessi sulle tabelle (select, alter, drop, truncate, ecc.) tranne quello di creare nuovi database.
Io sono sempre dell'idea che tutto il problema sia solo dovuto ai permessi.
Dovresti anche controllare, tramite programma FTP, il proprietario delle cartelle e dei file.
Sui sistemi linux non basta avere permessi di lettura/scrittura/esecuzione su cartelle e file, andrebbe anche verificato chi è il proprietario della cartella.
Ciao e buone feste