Ciao,
non è normale, perchè il pacchetto da .13 a .13b contiene tre aggiornamenti per: administrator, components e includes, che vanno sovrascritti a quelli già presenti nella cartella di joomla.
Ti consiglio però, di fare l'upgrade alla 1.0.14 appena rilasciata, che risolve un problema di sicurezza. La procedura è uguale: scompatti il pacchetto, copi il contenuto e lo sovrascrivi all'interno della cartella di joomla (magari fai prima un backup di sicurezza).
Ciao