ciao,
se non hai bisogno del banner, puoi toglierlo dal lato amministrativo
Moduli->Moduli Sito, cerca la voce Banner e sulla colonna pubblicazione togli il visto. a questo punto non avrai + il banner.
se invece lo vuoi mantenere, dovei spostare il codice php che lo richiama dal suo template in index.php dela relativa cartella o modificare la sua posizione.
buon lavoro