Per inserire codice javascript esistono sostanzialmente due modi:
- inserire il codice direttamente nell'editor di un modulo, senza bisogno di estensioni aggiungive; ma per far ciò devi ricordarti di disabilitare prima l'editor dalle proprietà utente (Gestione Utenti-->tuo utente-->nessuno editor WYSIWYG); infatti se inserisci il codice, l'editor sovrascrive quello che hai scritto con la sua formattazione ed è per questo che non vedi più niente!

- installare moduli che consentono di inserire direttamente codice javascript e a volte anche php; ce ne sono diversi; io ho provato "ViviCode", e "userFriendJS" e sono entrambi semplici e validi e, tra l'altro, sviluppati da italiani!

Il secondo puoi scaricarlo direttamente dalla sezione download di questo sito; lo trovi qui:
http://download.joomla.it/index.php?option=com_docman&task=doc_download&gid=105&&Itemid=2Spero di esserti stato utile!

Ciao!