Io farei così: sceglierei come contatore Histats, che ti fa scegliere il numero di visite iniziale. Indicherei come valore di partenza quello delle statistiche Joomla, e poi mi occuperei di inserire il modulo. Per quest'ultima operazione occorre disattivare momentaneamente L'editor visuale (configurazione -> sito -> editor predefinito -> no editor) e poi creerei un modulo html personalizzato, incollando il codice fornito da Histats. Naturalmente bisogna specificare che il modulo deve apparire in tutte le sezioni.