Allora ho risolto
Ho visto tra le configurazioni di sh404sef e nella scheda avanzate c'è la voce:modalità rescrivibile
era impostato come :senza .htasccess (index.php) e quindi non funzionava
invece mettendolo su senza .htasccess (index.php?) funziona, la cosa strane e che funziona sia se ho il file .htaccess e sia che ho il file htaccess.txt

Come lo imposto?? e che file metto?? che consigliate??