no, non comporta svantaggi significativi. Solo che alcuni vantaggi relativi alle nuove API vengono perduti. Ovviamente, credo che, comunque, si tratti di una situazione temporanea. Pian piano tutte le estensioni per joomla 1.0.x vengono convertite dagli autori in versioni per joomla 1.5.x
Quindi, se al momento ti serve attivarlo, non preoccuparti gran che