Ciao, sembrerà banale ma ti assicuro che non lo è: controlla di aver copiato correttamente tutte le cartelle e i files, potresti anche provare a ricopiare tutto via ftp.
A proposito, che client ftp usi? Prova filezilla e durante il trasferimento controlla nella casella in basso i trasferimenti non completi in modo tale da rielaborare la coda; sembrerà strano ma capita di frequente, controlla tutto l'upload, ciao!
