Per i numeri aggiunti nell'url credo che il sistema SEO di joomla numeri le categorie. Ma direi che non dovresti darci peso.

I files da sovrascrivere per modificare quella tabella (tutte le tabelle delle categorie, non solo quella, beninteso) è:
\components\com_content\views\category\tmpl\default_items.php
e
\components\com_content\views\category\tmpl\default.php

Ma per mostrare le tabelle degli articoli visione categoria così brutte credo che il tuo template faccia già l'override di quei files. Prova a controllare se c'è una cartella html dentro la cartella principale del template.