ah, svn!!! Allora vediamo...
Del FAP ci sono i pacchetti di installazione.
In pratica, si installa joomla e su questa si applica FAP che è costituita da componente, template e altre modifiche al core di joomla.
Quando ci sono degli aggiornamenti di joomla, la fap deve essere riapplicata, quindi, nel frattempo che viene "ripacchettizzata" l'intera FAP, si applica quella precedente poi si accede all'svn (in pratica è uno spazio in cui ci sono i file con le varie modifiche effettuate in modo progressivo ed è sempre aggiornato) dall'svn si prendono i file più aggiornati e si applicano alla installazione joomla+fap esistente.
Diciamo che svn è la fonte da cui poi si "pacchettizza".
Fra una release e l'altra puoi comunque avere i file aggiornati attingendo direttamente alla fonte