Se può tranquillizzarvi vi dico che io personalmente lo abilito subito dopo aver fatto l'installazione di joomla sui server per qualsiasi sito che faccio; come detto da enzoschi non comporta alcun problema, anzi vi evita in futuro di andarvi a scervellare del perchè magari non funziona bene un'estensione nativa per la 1.0 ma utilizzabile in legacy con la 1.5.
In ogni caso attenzione! Andate sempre a verificare nella colonna di dx (gestione plugin - moduli)l'effettiva compatibilità dell'estensione una volta che la installate.