Ciao Sigo,
anche io avevo il tuo stesso problema, cercando in giro ho trovato la seguente soluzione
Bisogna modificare un file del modulo mainmenu:
modules/mod_mainmenu/helper.php (riga 351)
sostituire
$tmp->url = JURI::base();
con
$tmp->url = str_replace(array($tmp->route.'/', $tmp->route), '', JRoute::_( $tmp->url ));
Attenzione:
Ti consiglio di
1. fare una copia dell'originale;
2. fare una copia anche del file modificato, in quanto, con un aggiornamento di versione di Joomla tale file potrebbe essere sovrascritto
ciao da Alessandro