se il software di cui parli è un applicativo allora è molto probabile che quell'applicativo abbia una sua estensione per "andare" in rete..
magari costa tanto, ma tieni presente che di applicativi ce ne sono miliaia quindi è impossibile rispondere a questo tipo di domande...
per una soluzione professionale io userei la estensione web dell'applicativo e se non la tiene allora cambierei applicativo oppure penserei a un sito web autonomo dall'applicativo..