L'unico modo che conosco per farlo è javascript
Accedere all'elemento attraverso le funzioni combinate document.getElementById e getElementsByTagName e poi quando si è certi di avere "centrato" l'elemento utilizzare la funzione
className.
Ora, io non mi sono mai cimentato nella creazione di un plugin per joomla, ma credo si possa creare un plugin contenente lo script che andrebbe a eliminare la classe in questione, che attraverso la gestione plugin attiverai solamente nella homepage.
EDIT : Ora che ci penso, abbiamo a disposizione Mootools e possiamo utilizzare le sue funzioni per trovare gli elementi e modificare il DOM.
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quiRE-EDIT : Cmq il mio consiglio è di scrivere l'articolo senza formattazione di colonne e poi creare il plugin che aggiunga la classe nell'articolo completato. Così chi ha javascript disabilitato vedrà tutto correttamente e chi lo ha abilitato si godrà l'effetto impaginazione