non la so la risposta, ma è poi cosi importante?
per il seo di joomla, valuta che è solo una riscrittura quindi a google non devi comunicare niente, un url pre-riscrittura viene automaticamente reindirizzato al nuovo post-riscrittura dal file .htaccess cioè da apache, visto che il file .htaccess è un file di apache..
ovviamente in una lamp normalmente settata.