Ti chiedo scusa ma sono alle prime armi con joomla.
Dunque, nella Configurazione Globale del backend, la configurazione SEO è attivato il Friendly url, mentre il rewrite e l'aggiunta del suffisso all'url non sono attivati.
Ieri sera stavo guardando che il problema persiste anche nelle categorie, ad esempio: se clicco sulla Categoria Floor Lamps, a sinistra mi mostra l'elenco degli articoli pubblicati in tale categoria tuttavia, essendo comunque pubblicati, cliccando sull'articolo "Tuorlo" mi restituisce errore 404 e come url
..floor-lamps/12-tuorlo-duovo.
Altro esempio:
L'url delle Sezioni (...index.php/Products/) è dello stesso tipo delle Categorie (index.php/floor-lamps/)