Uno è tentato di credere che i permessi impostandoli a 777, ovvero con la massima apertura, il sito debba vedersi, ma non è così con i server linux.
Ricordate sempre che con qualsiasi CMS c'è da considerare l'utente web, l'utente ftp, e l'utente apache.
Quindi tre utenti e tre proprietari diversi, utenti che niente hanno a che vedere con gli utenti di joomla o di qualsiasi altro csm.