Guarda, se vuoi stare sicuro FAI SEMPRE IL BACKUP.
Le estensioni, qulasiasi siano, plugin moduli o componenti li devi tutti elencare, spulciare nella JED se ci sono versioni compatibili con la 3.1 e per alcune se sei fortunato troverai l'aggiornamento che funziona sia con la 2.5 e sia con la 3.1 mentre per altre dovrasi prima disinstallarle e poi re-installarle nella nuova versione. Altre se se sfortunato dovrai sostituirle...
Io stsso mi sto facendo le ossa migrando piano piano alcuni siti dalla 2.5 alla 3.1 e fino ad ora tutto bene, ma in automatico non c'é niente.
E' un lavoro certosino ma appagante