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Il problema è che questo è un CONTENT MAMBOT, ossia un plugin che viene attivato sui CONTENUTI. Nel tuo caso, le animazioni Flash non sono nei contenuti, ma all'interno dei moduli!!! Ecco perchè non viene nemmeno aggiunto lo script di attivazione. Che io sappia non c'è la possibilità di fare un mambot con attivazione estesa ai moduli..
Quello che ti conviene fare a questo punto, è inserire manualmente nel template il collegamento allo script di attivazione, quello che diceva TullioWeb, ovviamente cambiando "127.0.0.1/web/" con il tuo indirizzo, quindi:
<script src="http://www.soundpassion.it/sito/mambots/content/flashactivation/AC_RunActiveContent.js" type="text/javascript"></script>
Questo codice va messo nella index.php del template che stai usando, prima della chiusura dell'intestazione: </HEAD>.
Non è però finita, dovrai modificare i moduli (o dove stanno i tuoi filmati Flash), cambiando gli oggetti flash (tag OBJECT), con un codice script tipo questo:
<script type="text/javascript">
AC_FL_RunContent( 'codebase','http://download.macromedia.com/pub/shockwave/cabs/flash/swflash.cab#version=6,0,29,0','width','594','height','224','src','animazioneflash','quality','best','pluginspage','http://www.macromedia.com/go/getflashplayer','movie','animazioneflash','wmode','transparent','scale','' ); //end AC code
</script><noscript><object classid="clsid:D27CDB6E-AE6D-11cf-96B8-444553540000" codebase="http://download.macromedia.com/pub/shockwave/cabs/flash/swflash.cab#version=6,0,29,0" width="594" height="224" vspace="5" hspace="5">
<param name="movie" value="animazioneflash.swf" />
<param name="src" value="animazioneflash.swf" />
<param name="play" value="true" />
<param name="wmode" value="transparent" />
<param name="scale" value="" />
<param name="quality" value="best" />
<param name="menu" value="false" />
<param name="bgcolor" value="" />
<param name="AllowScriptAccess" value="sameDomain" />
<param name="loop" value="true" />
<embed src="animazioneflash.swf" scale="" wmode="transparent" play="true" quality="best" menu="false" pluginspage="http://www.macromedia.com/go/getflashplayer" type="application/x-shockwave-flash" width="594" height="224" bgcolor="" AllowScriptAccess="sameDomain" loop="true" hspace="5" vspace="5"></embed>
</object></noscript>
cambiando, ovviamente "animazioneflash" in base al nome del file, e "width" / "height" in base alla larghezza e all'altezza....