Se il sito ti funziona ancora allora quelle tabelle dovrebbero esserci.
Fai un bel backup generale, poi prova in Phpmyadmin, nel tab SQL, prova a eseguire questa query:
ALTER TABLE jhost_redirect_links MODIFY old_url varchar(255);
ALTER TABLE jhost_redirect_links MODIFY new_url varchar(255);
ALTER TABLE jhost_categories MODIFY access integer unsigned;
ALTER TABLE jhost_contact_details MODIFY access integer unsigned;
ALTER TABLE jhost_extensions MODIFY access integer unsigned;
ALTER TABLE jhost_menu MODIFY access integer unsigned;
ALTER TABLE jhost_modules MODIFY access integer unsigned;
ALTER TABLE jhost_newsfeeds MODIFY access integer unsigned;
Se poi vedi che scompare la prima segnalazione nella gestione estensioni-->database allora proseguiamo con le altre.