per rispondere alla tua ultima domanda si.
ipotiziamo che tu abbia
www.tuodominio.it e che tu mi stia chiedendo di installare joomla nella cartella /sottodominio ovviamente non c'e' alcun problema nel farlo.
per installarlo dovrai andare a
www.tuodominio.it/sottodominio e da li inizierai.
per quanto riguarda l'utilizzo degli ftp, sono software che, collegandosi ad una precisa porta, su un computer configurato x ricevere quel tipo di connessioni ti permettono di caricarci sopra dei file.
io uso filezilla, ma non so se esite su mac, nel caso uhm, cyberduck x mac, molto facile, un po primitivo

.
dopo averlo scaricato dovrai inserire i dati che ti ha dato il tuo hoster e ti connetterai alla / del tuo sito, per tornare all'esempio di prima se vuoi installarlo in /sottodominio devi fare cosi:
in locale avrai scaricato joomla, lo avrai scompattato e (per lo meno io faccio cosi) rimonimato tutta la cartella in /sottodominio
a questo punto col tuo bel ftp sposti la cartella intera nella / del tuo dominio.
a questo punto apri un browser e digiti
www.tuodominio.it/sottodominio ed inizi l'installazione.
spero di essere stata esaustiva.
in bocca al lupo!