Io ho fatto così:
nel file index.php del mio template ho cercato la posizione nella quale volevo inserire il modulo, nel tuo caso devi cercare un tag simile a <div id="header"> e all'interno devi inserire:
<div id="nomechevuoi">
<?php mosLoadModules('nomespazioperilmodulo', -1); ?>
</div>
dove nomechevuoi è l'id del div che ti permette di impostare delle proprietà nel CSS, mentre nomespazioperilmodulo è il nome che poi ti troverai in Joomla! (tipo advert1, user1, ecc...)
Fatto questo devi andare nel backend Site-->Template Manager-->Site Template e in uno spazio vuoto inserire nomespazioperilmodulo
Poi con Site-->Preview-->Inline with position puoi vedere se è stato riconosciuto il nuovo spazio per il modulo.
Non mi ricordo più il significato di -1 ci sono un paio di valori che può assumere quel parametro, prova a cercare in rete...
Saluti!
