Cercavo la stessa cosa perchè cerco di migrare alla 3.x anche io è ho trovato questa spiegazione:
Questa la procedura manuale: estrarre il pacchetto di aggiornamento sul proprio PC e caricare via FTP tutti i file e le cartelle all'interno della cartella
tmp del proprio sito (verificando prima che questa sia completamente vuota o con il solo file index.html). In amministrazione, dalla
Gestione estensioni➜Installa da cartella premere sul tasto installa. Al termine dell'installazione cancellare via FTP il contenuto presente nella cartella tmp (tranne il file index.html).
Ovviamente effettuare un backup completo (file e database) prima di ogni aggiornamento. Verificare anche se le eventuali estensioni esterne installate sono già pienamente compatibili con la nuova versione di Joomla.